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AI分析蛋白结构 动态追踪病毒变异

图:杭州杰毅生物开发了全自动高通量测序建库仪/网络图片  近日,浙江省疾控中心上线自动化的全基因组检测分析平台,利用阿里达摩院研发的AI算法,将原来数小时的疑似病例基因分析缩短至半小时,并能精准检测出病毒的变异情况。  「目前,主流检测手段为核酸检测方法。」达摩院算法专家顾斐博士指出,这项技术实际检测时间相对较长,而且只能检测到病毒基因的局部。由于病毒存在变异可能,因此核酸检测可能会出现假阴性、假阳性的情况。  把关后期防疫 提升确诊效率  不同于核酸检测,新的分析平台是对样本进行全基因组序列分析比对,能够有效防止漏检。此外,平台有效缩短了全基因测序的时间。「越往后走,越需要全基因检测,因为后期防疫的核心是防止病毒变异。」顾斐说。  顾斐介绍,在整个平台中,合作夥伴杰毅生物开发了全自动高通量测序建库仪,把常规人工需要12小时的工作缩短到2个小时。  「每次测序过程中产生的海量基因数据,则交由达摩院AI算法进行分析。」顾斐说,他们将病毒基因分析的速度由数小时缩短到半小时。同时,病毒序列拼接的速度由30分钟-1小时缩短到15-30分钟。  由此,AI算法可以在15-30分钟内预测病毒蛋白二级结构,从而帮助医护人员检测到病毒全貌,使得变异的病毒也能精准检测,大幅提升确诊效率。  记者 俞昼

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本文来源:新大发代理 责任编辑:福彩快乐十分网址 2020年02月20日 07:18:46

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